La resistencia antimicrobiana es un fenómeno creciente, que constituye una amenaza mundial. Se realizó un estudio retrospectivo, en el Departamento de Microbiología Clínica del Instituto “Pedro Kourí”, durante los años 2011 y 2012, para describir los fenotipos de resistencia en bacterias de interés clínico (Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp., Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii) aisladas en este período de tiempo, provenientes de pacientes atendidos en la consulta externa y hospitalizados. Los fenotipos se detectaron mediante el sistema Vitek 2 Compact (bioMérieux). Los datos se procesaron a través del sistema Observa (versión R03.00, bioMerieux). De las bacterias identificadas en este período predominó E.coli (47,2%), seguida por S.aureus (23,2%). K.pneumoniae prevaleció en pacientes hospitalizados (27,2%). En S.aureus la resistencia  a  meticilina se identificó en 77,4% y 59,4% de las infecciones en pacientes hospitalizados y comunitarios, respectivamente, y el 50% mostró resistencia a macrólidos por eflujo. En las enterobacterias identificadas resaltó la resistencia a betalactámicos por betalactamasas de espectro extendido, fundamentalmente en K.pneumoniae, que mostró este fenotipo en 30,6% de los aislamientos provenientes de la consulta externa y en 55,8% de pacientes hospitalizados. Se demostró resistencia a carbapenémicos por impermeabilidad en P.aeruginosa en 37,2% y 19% (consulta externa y pacientes hospitalizados, respectivamente). La resistencia a meticilina en S.aureus, las betalactamasas de espectro extendido en las enterobacterias y la impermeabilidad a carbapenémicos en los bacilos no fermentadores, constituyen fenotipos de resistencia significativos, tanto en las infecciones procedentes de la comunidad como en las asociadas a los cuidados sanitarios.